Die Schulleitung der Kantonsschule Menzingen, bestehend aus der Rektorin Juliane Kade und den Prorektoren Jonas Balsiger, Michael Güntensperger und Patric Matter, führt die Schule und trägt mit allen Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern die Verantwortung für den Schulbetrieb und die Weiterentwicklung der Schule.

• Juliane Kade, Lic. phil. Englische Sprach- und Literaturwissenschaft, Geschichtswissenschaft, Rektorin
• Jonas Balsiger, MSc in Sportwissenschaften und Mathematik, Prorektor
  zugeteilte Klassen: 1b, 2b, 3c, 3f, 4c, 4f, 5c, 5f, 6f
• Michael Güntensperger, Dipl. Geogr., Prorektor
  zugeteilte Klassen: 3a, 3b, 4a, 4b, 5a, 5b, 6a, 6b
• Patric Matter, Dipl. Natw. ETH, Prorektor
  zugeteilte Klassen: 1a, 2a, 3d, 3e, 4d, 4e, 5d, 5e, 6c, 6d, 6e